Microbiote intestinal chez les chats et chiens
Microbiote intestinal et rôle des pré et probiotiques chez le chien et le chat
Savez-vous que votre chien ou votre chat héberge des millions de micro-organismes qui jouent un rôle essentiel dans leur santé globale ?
Le microbiote intestinal souvent appelé « flore intestinale » est un véritable écosystème vivant qui participe à la digestion, au métabolisme, à la synthèse des vitamines, à la protection contre les agents pathogènes et à l’immunité.
Chez les carnivores domestiques, un déséquilibre du microbiote peut être causé par de nombreux facteurs, tels qu’une alimentation inadaptée, des traitements médicamenteux, le stress, le vieillissement ou encore les maladies chroniques.
Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?
Le microbiote intestinal est l’ensemble des micro-organismes vivants (bactéries, levures, virus non pathogènes, champignons, protozoaires et archées) présents dans le tube digestif. Chaque individu a son propre microbiote qui évolue avec le temps et son équilibre est essentiel pour préserver la santé.
Chez le chien comme chez le chat, le microbiote joue un rôle fondamental dans :
- La digestion et l’assimilation des nutriments : le microbiote aide à la dégradation des protéines et des graisses
- L’immunité : 70 % des cellules immunitaires se trouvent dans l’intestin. Le microbiote aide à réguler la réponse immunitaire et protège contre les infections. Un microbiote équilibré limite le développement des bactéries pathogènes
- Le métabolisme : il participe à la production de vitamines (notamment du groupe B et la vitamine K), de nombreuses enzymes, des acides biliaires secondaires et des acides gras à chaîne courte (AGCC) qui nourrissent les cellules intestinales et favorisent une bonne santé digestive
- L’équilibre émotionnel : des études montrent un lien entre le microbiote et l’axe intestin-cerveau. La sérotonine, souvent appelée "l'hormone du bonheur", est principalement produite dans l'intestin. Un microbiote déséquilibré peut donc avoir un impact direct sur le comportement et sur le stress

Image : https://www.lapsa-lab.fr/gamme-integrale
- Chez le chien, le microbiote est très diversifié et varie selon la race, l’âge et l’alimentation. Il contient des bactéries bénéfiques que l’on retrouve principalement dans le gros intestin et le côlon

- Chez le chat, le microbiote est plus stable et adapté à son régime de carnivore. Les bactéries fermentescibles y sont moins présentes que chez le chien. Un excès de fibres peut perturber son équilibre

Déséquilibre du microbiote : causes et conséquences
Lorsque le microbiote est déréglé, perturbé ou fortement attaqué par des traitements, on parle de dysbiose intestinale. Cette dysbiose peut être causée par :
- Une alimentation inadaptée, déséquilibrée ou industrielle avec des aliments transformés, trop riche en glucides, en additifs, pauvre en fibres ou pauvre en protéines de qualité
- Le stress lié à des changements ou au stress des humains
- L’usage des antibiotiques, des anti-inflammatoires, des vermifuges ou encore des antiparasitaires qui détruisent les bonnes bactéries
- Une maldigestion liée à un changement alimentaire
- La pollution environnementale dont les toxines peuvent altérer l'équilibre du microbiote
- Une maladie chronique, une maladie génétique ou des troubles intestinaux

Une dysbiose du microbiote intestinal a un impact sur le métabolisme et joue un rôle sur l’immunité, le comportement, les troubles digestifs et dermatologiques. Mais aussi, sur l’obésité, sur le fonctionnement cérébral, rénal et hépatique.
Plusieurs études ont montré que les traitements médicamenteux avaient un impact sur le microbiote intestinal et que la récupération complète du microbiote pouvait prendre jusqu'à plusieurs mois.
(Pilla et al. - 2020 - chiens, Marclay et al. - 2022 - chiens, Werner et al., - 2020 - chiens)
Les signes d’une dysbiose intestinale sont :
- Troubles digestifs : diarrhée, constipation, flatulences
- Modification de l’appétit : perte ou augmentation de l’appétit
- Perte ou prise de poids : mauvaise absorption des nutriments
- Problèmes de peau et de pelage : allergies, démangeaisons, irritations, perte de poils, poils ternes
- Réactions inflammatoires et sensibilité aux infections : allergies, infections des oreilles, des voies urinaires et des voies respiratoires
- Changements comportementaux : stress, anxiété, agressivité, léthargie
Quelle est la différence entre les prébiotiques et les probiotiques ?
Les prébiotiques pour nourrir le microbiote :
Les prébiotiques sont des ingrédients alimentaires non digestibles qui nourrissent et qui favorisent le développement des bactéries bénéfiques déjà présentes dans le gros intestin/côlon. L’idéal est d’en apporter quotidiennement ou régulièrement dans la ration pour alimenter, favoriser et stimuler la flore existante.
Les prébiotiques les plus courants :
- Les amidons résistants : ne sont pas digérés dans l’intestin grêle et fermentent au niveau du gros intestin pour nourrir les bonnes bactéries -> riz cuit au minimum 45 min et refroidi pendant 24 heures, patates douces, légumineuses (lentilles vertes, pois cassés, …), bananes vertes (à éviter chez le chat), etc.
- Les FOS (fructo-oligosaccharides) et l’inuline qui font parties de la famille des fructanes : stimulent la croissance des bifidobactéries et des lactobacilles, et réduisent la prolifération des bactéries potentiellement pathogènes -> topinambours, salsifis, melons, racine de chicorée, etc.
- Les MOS (mannan-oligosaccharides) : extraits de la paroi de levures notamment de la levure Saccharomyces cerevisiae qui favorisent les bactéries bénéfiques, limitent les pathogènes et ont un effet sur la santé digestive globale -> levure de bière
- Les β-glucanes (bêta-glucanes) -> polysaccharides naturels qui ont un rôle sur l’immunité -> champignons (pleurote, shiitaké, reishi, etc.), parois de certaines céréales (orge, avoine, sorgho), etc.
- Les fibres végétales : stabilisent le microbiote, améliorent la digestion et l’absorption des nutriments -> pomme, psyllium, etc.
- Les polyphénols : composés bioactifs d’origine végétale aux propriétés antioxydantes et anti-inflammatoires -> fruits (framboises, fraises, mûres, grenades, …), baies (canneberges, myrtilles, …), légumes (brocolis, poivrons verts, épinards, …), etc.
- Les produits fermentés et lactofermentés : améliorent la digestion et réduisent les troubles digestifs -> kéfir de lait, yaourt nature, levure de bière vivante, légumes lactofermentés (choux blancs, carottes), etc.
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Effets démontrés : - Amélioration de la consistance des selles et réduction des diarrhées (Propst et al. - 2003 - chiens) - Augmentation de la diversité bactérienne et meilleure tolérance digestive (Barry et al. - 2010 - chats) - Soutien immunitaire et réduction des marqueurs inflammatoires (Li et al., - 2019 - chats) |
Les probiotiques pour restaurer l’équilibre après un déséquilibre :
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Les probiotiques sont des micro-organismes vivants, principalement des bactéries et des levures, qui peuplent le gros intestin/côlon et qui contribuent à la santé digestive. Les principales souches utilisées sont les lactobacilles et les bifidobactéries pour améliorer la digestion, réduire les troubles digestifs et (ré)équilibrer la flore intestinale. |
Ils sont très utiles pour renforcer le microbiote intestinal en équilibrant la flore bactérienne en cas de maladies, après un traitement chimique (antibiotiques, anti-inflammatoires, vermifuges et antiparasitaires par voie interne), en cas de stress et pour accompagner une transition alimentaire.
Comment entretenir et soutenir le microbiote intestinal sain chez le chien et le chat ?
- Une alimentation naturelle adaptée et équilibrée riche en fibres et en nutriments essentiels
- Un apport riche en protéines animales de qualité
- En évitant les aliments transformés comme les croquettes et les excès de glucides
- Un apport régulier en pré-biotiques :
- Chez le chien, des fibres fermentescibles comme la racine de chicorée, la banane verte, la patate douce, la levure de bière, etc. pour nourrir les bonnes bactéries
- Chez le chat, on limite les fibres et on évite les glucides inutiles car son microbiote est conçu pour digérer principalement les protéines et les graisses
- Un apport en petite quantité d’aliments fermentés/lactofermentés naturellement
- Une gestion du stress à l’aide de plantes adaptogènes ou de fleurs de Bach, en cas de déménagement, arrivée d'un nouveau membre ou congénère, séjour en pension, etc.
- Un environnement stable, enrichi et adapté à ses besoins en assurant une routine pour limiter les facteurs anxiogènes
- Un usage limité et raisonné des antibiotiques, des anti-inflammatoires, des vermifuges et des antiparasitaires chimiques
- Une cure de probiotiques
- Après un traitement chimique pour réensemencer le microbiote
- En cas de troubles digestifs importants
- En cas de changement alimentaire pour faciliter la transition
- En prévention saisonnière pour faciliter les changements de saison et renforcer l'immunité
- En accompagnement de l’animal vieillissement pour soutenir son système immunitaire
Chez le chien et le chat, le microbiote intestinal est un pilier de la santé globale. En plus d’une alimentation saine et équilibrée, les prébiotiques nourrissent et entretiennent les bactéries bénéfiques et les probiotiques restaurent l’équilibre, notamment après un traitement chimique. Ce sont des alliés naturels indispensables pour la santé digestive et immunitaire qui aident à prévenir de nombreux troubles. Ils doivent être adaptés à l’espèce et au contexte physiologique.
Comme l’affirmait si bien Hippocrate : « Que ton aliment soit ton médicament et que ton médicament soit ta nourriture ».
Faites appel à un Naturopathe Animalier qui vous conseillera sur les aliments, les produits et les dosages adaptés aux besoins spécifiques de votre chien ou de votre chat.

La naturopathie animale ne remplace pas une consultation vétérinaire.
Les conseils proposés ont pour objectif d’améliorer le bien-être de votre animal mais ne prétendent pas traiter de maladie.
Sabrina SOURBIER
Naturopathe Animalier
Animopathe
Lyon – Rhône
https://animopathe.fr/
Sources :
Références :
- Pierre May, Guide pratique de phyto-aromathérapie pour les animaux de compagnie (2ème édition), Editions Med'com
- Pilla et al., (2020) - Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome of dogs (Frontiers / Comparative Medicine / PubMed/PMC)
- Marclay et al., (2022) - Recovery of fecal microbiome and bile acids in healthy dogs after antibiotic administration (PMC article)
- Werner et al., (2020) - Effect of amoxicillin–clavulanic acid on clinical scores, intestinal microbiota and antimicrobial resistance in dogs with acute diarrhoea (PubMed & PMC)
- Propst EL et al. (2003) - Effects of a fructooligosaccharide-supplemented diet on fecal characteristics in dogs (Am J Vet Res)
- Barry KA et al. (2010) - Dietary cellulose, fructooligosaccharides, and pectin modify fecal protein catabolites and microbial populations in adult cats (J Anim Sci)
- Li Q et al. (2019) - Effects of inulin supplementation on the gut microbiota and immune function of cats (Vet Microbiol)

